目前，一般使用的河道污水處理方法有三種，分別是物理方法、 化學方法、 生態--生物法(包括河道曝氣復氧、生物膜法、生物修復法、土地處理法、水生植物凈化法)。
1、物理方法
物理方法主要是指疏挖底泥、機械除藻、引水沖淤和調水等。疏浚污染底泥意味著將污染物從(河道)系統中清除出去。可以較大程度地削減底泥對上覆水體的污染貢獻率，從而改善水質。
調水的目的是通過水利設施(如閘門、泵站)的調控引入污染河道上游或附近的清潔水源以改善下游污染河道水質。
此類方法往往治標不治本。
2、化學方法
化學方法如混凝沉淀、加入化學藥劑殺藻、加入除磷劑促進磷的沉淀、加入氨氮去除劑脫氮等方法。
研究表明，這種方法對濁度、COD、SS、TP去除效果較好，對TN、重金屬等也有一定的去除效果，日藥劑用量少。
3、生態—生物法
3.1 河道曝氣法

人工曝氣復氧是指向處于缺氧(或厭氧)狀態的河道進行人工充氧以增強河道的自凈能力，改善水質、改善或恢復河道的生態環境。
河道曝氣復氧一般采用固定式充氧站和移動式充氧平臺兩種形式。
該工藝具有設備簡單、機動靈活、安全可靠、投資省、見效快、操作便利、適應性廣、對水生生態不產生任何危害等優點，適合于城市景觀河道和微污染源水的治理。
3.2 生物膜技術
生物膜技術是指使微生物群體附著于某些載體的表面上呈膜狀，通過與污水接觸，生物膜上的微生物攝取污水中的有機物作為營養吸收并加以同化，從而使污水得到凈化。
目前，常用于河道污水治理的生物膜技術主要有接觸氧化法、生物活性炭填充柱凈化法、薄層流法和伏流凈化法，用得比較多是接觸氧化法。
3.3 生物修復技術
生物修復技術是指利用微生物及其他生物，將水體或土壤中的有毒有害污染物質現場降解為CO2和H2O，或轉化為無毒無害物質的工程技術系統。
用于河道污水治理的生物修復技術主要有兩類。

1)直接向污染河道水體投加經過培養篩選的一種或多種微生物菌種，試驗證明COD去除率可達90%以上。
2)向污染河道水體投加微生物促生劑(營養物質)，促進“土著”微生物的生長。


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